longitudinalData

Package: longitudinalData
Type: Package
Title: Longitudinal Data
Version: 2.4.1
Date: 2016-02-02
Authors@R: c(person("Christophe","Genolini",role=c("cre","aut"),email="christophe.genolini@u-paris10.fr"),person("Bruno","Falissard",role="ctb"),person("Dai","Fang",role="ctb"),person("Luke","Tierney",role="ctb"))
Description: Tools for longitudinal data and joint longitudinal data (used by packages kml and kml3d).
License: GPL (>= 2)
LazyData: yes
Depends: methods, clv, class, rgl, utils, misc3d
URL: http:www.r-project.org
Collate: global.r function.r constants.r myMisc3d.r longData.r
longData3d.r distanceFrechet.R imputCross.R imputTraj.R
imputLinearInterpol.R imputCopyMean.R imputation.r partition.r
listPartition.r parLongData.r parWindows.r newPlot.r
Encoding: latin1
NeedsCompilation: no
Packaged: 2016-02-11 15:12:02 UTC; Christophe
Author: Christophe Genolini [cre, aut],
Bruno Falissard [ctb],
Dai Fang [ctb],
Luke Tierney [ctb]
Maintainer: Christophe Genolini <christophe.genolini@u-paris10.fr>
Repository: CRAN
Date/Publication: 2016-02-16 15:40:46

Install log

* installing to library '/home/ddbj/local/lib64/R/library'
* installing *source* package 'longitudinalData' ...
** package 'longitudinalData' successfully unpacked and MD5 sums checked
** R
** data
*** moving datasets to lazyload DB
** preparing package for lazy loading

####################################################################
############################## Function ############################
####################################################################
### Functions accepting NA ###
++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
++++++++++++++++++++++++++++ Fin Function ++++++++++++++++++++++++++
++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++

### Constantes ###

####################################################################
########################## Class LongData ##########################
############################# Creation #############################
####################################################################
### Definition ###

###################################################################
########################## Class LongData #########################
########################### Constructeur ##########################
###################################################################

###################################################################
########################## Class LongData #########################
############################ Accesseurs ###########################
###################################################################
### Getteur ###

###################################################################
########################## Class LongData #########################
############################# Affichage ###########################
###################################################################
### Method: 'show' pour LongData ###
### Method: 'print' pour LongData ###
Creating a generic function for 'print' from package 'base' in package 'longitudinalData'

###################################################################
########################## Class LongData #########################
############################## Various ############################
###################################################################
Creating a generic function for 'scale' from package 'base' in package 'longitudinalData'

-------------------------------------------------------------------
-------------------------- Class LongData -------------------------
------------------------------- Fin -------------------------------
-------------------------------------------------------------------

####################################################################
######################### Class LongData3d #########################
############################# Creation #############################
####################################################################
### Definition ###

###################################################################
########################## Class LongData #########################
########################### Constructeur ##########################
###################################################################

###################################################################
########################## Class LongData #########################
############################ Accesseurs ###########################
###################################################################
### Getteur ###

###################################################################
########################## Class LongData #########################
############################# Affichage ###########################
###################################################################
### Method: 'show' pour LongData3d ###
### Method: 'print' pour LongData3d ###

###################################################################
########################## Class LongData #########################
############################## Various ############################
###################################################################

-------------------------------------------------------------------
-------------------------- Class LongData -------------------------
------------------------------- Fin -------------------------------
-------------------------------------------------------------------
###################################################################
########################### class matrix ##########################
################### Imputations des manquantes ####################
###################################################################
###################################################################
########################### class matrix ##########################
################### Imputations des manquantes ####################
###################################################################
###################################################################
########################### class matrix ##########################
################### Imputations des manquantes ####################
###################################################################

###################################################################
########################## Class LongData #########################
############################ Imputation ###########################
###################################################################

+++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
++++++++++++++++++++++++++ Class LongData +++++++++++++++++++++++++
++++++++++++++++++++++++++ Fin Imputation +++++++++++++++++++++++++
+++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++

###################################################################
########################## Class Partition ########################
############################# Criterion ###########################
###################################################################
####################################################################
########################## Class Partition #########################
############################# Creation #############################
####################################################################
### Definition ###

####################################################################
########################## Class  Partition ########################
############################ Constructeur ##########################
####################################################################
### Method : 'show' for partition ###

####################################################################
########################## Class Partition #########################
############################# Accesseurs ###########################
####################################################################
### Getteur ###
### Setteur ###

####################################################################
########################## Class Partition #########################
############################### Autre ##############################
####################################################################

--------------------------------------------------------------------
------------------------ Fin Class Partition -----------------------
--------------------------------------------------------------------
####################################################################
######################## Class ListPartition ######################
############################## Creation ############################
####################################################################
### Definition ###
####################################################################
######################## Class ListPartition ######################
############################ Constructeur ##########################
####################################################################

####################################################################
######################## Test  ListPartition ######################
############################# Accesseurs ###########################
####################################################################
### Setteur ###
### Getteur ###
####################################################################
######################## Class ListPartition ######################
############################## Affichage ###########################
####################################################################
### Method : 'show' for yPartition ###

####################################################################
######################## Class ListPartition ######################
############################### Autres #############################
####################################################################
Creating a generic function for 'ordered' from package 'base' in package 'longitudinalData'
--------------------------------------------------------------------
------------------------ Class ListPartition ----------------------
------------------------------ Creation ----------------------------
--------------------------------------------------------------------

####################################################################
######################### Class parLongData ########################
############################# Creation #############################
####################################################################

###################################################################
######################## Class parLongData ########################
########################### Constructeur ##########################
###################################################################
### Method : 'show' for ParLongData ###
### Getteur ###
### Setteur ###

--------------------------------------------------------------------
----------------------- Fin Test ParLongData -----------------------
--------------------------------------------------------------------

####################################################################
######################### Class parWindows #########################
############################# Creation #############################
####################################################################

###################################################################
######################### Class parWindows ########################
########################### Constructeur ##########################
###################################################################
### Method : 'show' for ParWindows ###
### Getteur ###
### Setteur ###

--------------------------------------------------------------------
-------------------------- Fin ParWindows --------------------------
--------------------------------------------------------------------
+++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
++++++++++++++++++++++++++ Class LongData +++++++++++++++++++++++++
+++++++++++++++++++++++++++++++ plot ++++++++++++++++++++++++++++++
+++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
### Method: 'plot' pour LongData et Partition, divers ###
### Method: 'plot' pour LongData3d sans Partition ###
###################################################################
########################## Class LongData #########################
############################## plot3d #############################
###################################################################
###################################################################
########################## Class LongData #########################
############################# plot3dPdf ###########################
###################################################################

-------------------------------------------------------------------
------------------------ Class LongData plot ----------------------
------------------------------- Fin -------------------------------
-------------------------------------------------------------------
** help
*** installing help indices
  converting help for package 'longitudinalData'
    finding HTML links ... done
    Constants                               html  
    ListPartition-class                     html  
    LongData-class                          html  
    LongData3d-class                        html  
    ParLongData-class                       html  
    ParWindows-class                        html  
    Partition-class                         html  
    artificialJointLongData                 html  
    artificialLongData                      html  
    distFrechet                             html  
    expandParLongData                       html  
    imputation                              html  
    initializePartition                     html  
    longData-internal                       html  
    longData                                html  
    longData3d                              html  
    longDataFrom3d                          html  
    longDataTo3d                            html  
    longitudinalData-package                html  
    makeLatexFile                           html  
Rd warning: /tmp/RtmpuEnkRq/R.INSTALL187d38e24b15/longitudinalData/man/makeLatexFile.Rd:44: missing file link 'makeTriangles'
    ordered                                 html  
    parLongData                             html  
    parWindows                              html  
Rd warning: /tmp/RtmpuEnkRq/R.INSTALL187d38e24b15/longitudinalData/man/parWindows.Rd:25: missing file link 'split.screen'
    partition                               html  
    plot3dPdf                               html  
Rd warning: /tmp/RtmpuEnkRq/R.INSTALL187d38e24b15/longitudinalData/man/plot3dPdf.Rd:58: missing file link 'makeTriangles'
    plotAllCriterion                        html  
    plotCriterion                           html  
    plotTrajMeans                           html  
    plotTrajMeans3d                         html  
Rd warning: /tmp/RtmpuEnkRq/R.INSTALL187d38e24b15/longitudinalData/man/plotTrajMeans3d.Rd:45: missing file link 'rgl'
    qualityCriterion                        html  
    regroup                                 html  
    reshapeLong                             html  
    reshapeWide                             html  
    restoreRealData                         html  
    saveTrianglesAsASY                      html  
Rd warning: /tmp/RtmpuEnkRq/R.INSTALL187d38e24b15/longitudinalData/man/saveTrianglesAsASY.Rd:28: missing file link 'makeTriangles'
    scale                                   html  
    windowsCut                              html  
** building package indices
** testing if installed package can be loaded
* DONE (longitudinalData)
Making 'packages.html' ... done